Το 2017, στο πλαίσιο της οργάνωσης και λειτουργίας του Εργαστηρίου Ιστορικής Έρευνας και Τεκμηρίωσης, υπό τη διεύθυνση της ομότιμης καθηγήτριας κυρίας Όλγας Κατσιαρδή-Hering και σε συνεργασία με τον τωρινό διευθυντή του Εργαστηρίου αναπληρωτή καθηγητή κ. Βαγγέλη Καραμανωλάκη, εντοπίστηκαν επιπλέον φάκελοι και λυτά έγγραφα του προσωπικού αρχείου του καθηγητή Ν. Βλάχου. Αυτό το υλικό λάνθανε αποθηκευμένο στο Σπουδαστήριο Ιστορίας και σε άλλους χώρους της Φιλοσοφικής Σχολής. Το τμήμα αυτό του αρχείου ήταν ακατάτακτο και πολύ διαταραγμένο ως προς τη συνοχή του.
Η δρ. Χαρίκλεια Μπαλή, Ε.ΔΙ.Π., μέλος του Εργαστηρίου Ιστορικής Έρευνας και Τεκμηρίωσης, ανέλαβε την ταξινόμηση και την τεκμηρίωσή του. Επρόκειτο για 4.234 σελίδες, εκτός από τα επισυναπτόμενα μικρού μεγέθους σημειώματα. Ταξινομήθηκε σε επτά φακέλους, οι οποίοι αριθμήθηκαν ως συνέχεια του καταταγμένου τμήματος του Αρχείου, από τον αριθμό ΝΔ΄ έως Ξ΄.
Αξιοσημείωτο είναι ότι σημαντικό τμήμα των φακέλων αυτών περιλαμβάνει επίσης χειρόγραφες σημειώσεις του Ν. Βλάχου για τη δημοσίευση της συνέχειας του έργου του Ιστορία των κρατών της Χερσονήσου του Αίμου, 1908-1914. Ο πρώτος τόμος του αξιόλογου αυτού έργου εκδόθηκε το 1954. Ο ιστορικός ετοίμαζε τον δεύτερο τόμο, αλλά, λόγω του θανάτου του το 1956, δεν πρόλαβε να τον εκδώσει.